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主要研究方向为土地制度，特别利用自身具备的管理学、法学专业基础，在农地承包经营法律制度、农民土地财产权利保护制度的综合评价和完善研究中综合法学理论规范分析和模糊评判实证分析方法，开展管理学、法学、社会学等学科的交叉研究。
近年来，主持及完成国家社科基金1项、教育部人文社科项目1项、中国博士后基金1项、省博士后基金1项、省教育厅人文社科项目1项、校博士后和博士基金2项，武汉城市圈研究项目1项，哈尔滨市法学会重点研究课题3项；参加教育部社科重大攻关项目、国家社科基金重大项目、国家自然基金应急项目等3项国家级重大项目的研究工作；出版著作4部；取得了系列论文成果。在研究中深入5个省份的基层农村社会调研，并在2个典型村负责开展了全程驻村调查；获得省、市法学优秀工作者等多项个人奖励。已出版学术专著二部，参编著作二部。获得省科技进步三等奖1项、东北法治论坛优秀论文一等奖1项、三等奖1项、省社科年会优秀论文三等奖1项、市优秀法学成果二等2项、三等2项等学术奖励。
主持课题（近五年以主持人身份主持的部分课题）：
1.2010年国家社科基金青年项目《农民土地财产权利有效实现的法制保障研究》
2. 2011年黑龙江省哲学社科基金一般项目《被征地农民土地权利的法律保障机制研究》
3. 2009年教育部人文社会科学研究青年项目《农地承包经营法律制度的综合评价与完善研究》
4. 2010年第48批中国博士后科学基金项目《农民土地财产权利保护制度的评价与完善研究》
5. 2010年黑龙江省教育厅人文社科一般项目《黑龙江省土地承包经营权流转立法研究》
6. 2009-2010年度武汉城市圈研究会课题项目《武汉城市圈土地承包经营权流转立法研究》
7. 2010年中南财经政法大学博士后资助项目
8. 2009年东北农业大学博士科研启动基金项目
9. 2012年度黑龙江省博士后启动基金项目
发表著作：
1. 刘兆军. 农地承包经营法律制度的综合评价与完善研究，中国农业出版社，2014
2. 韩学平 刘兆军. 土地适度规模经营的法制保障问题研究，中国农业出版社，2013
3. 刘尊梅 刘兆军 聂婴智. 农业经营与农民权益法制保障专题研究，哈尔滨工业大学出版社，2010
代表性论文：
1. 韩学平，刘兆军：我国农民地权保护问题探析，《法学杂志》，2012年8期
2. 刘兆军，新生代无地农民工：边缘困境与制度保护，《农业经济问题》，2010年9期
3. 刘兆军，人权理念下的农民土地权利保护探析，《中国土地科学》， 2010年7期
4. 刘兆军，政策演进下的适度规模经营制度保障探析，《农村经济》，2010年8期
5. 刘兆军，新生代无地农民工社会保障问题研究，武汉理工大学学报（社科版），2010年4期
6. 刘兆军 韩学平，农村新政下的农民地权保护研究，《东北农业大学学报》（社科版），2010年3期
7. Zhaojun Liu，Research on Policy Choice of Protection for Farmer Workers Land Rights，2010 Second ETP/IITA World Congress in ACC会议论文，ISTP检索
8. Zhaojun Liu，Research on Policies Guarantee for Constructive Land Utilization in OldIndustrial Bases Revitalization of Heilongjiang Province，2010 Second ETP/IITA World Congress in ACC会议论文，ISTP检索 9. Zhaojun Liu，Interaction Relationship between Agricultural Insurance and Transfer of Land Contract Rights Based on Game Analysis of Farmer Selection, International Conference on Agricultural Risk and Food Security 2010会议论文，收录于ScienceDirect在线出版的Elsevier期刊论文：Agriculture and Agricultural Science Procedia,Volume 1,2010。
10. Liu Zhaojun，Research on Explanation and Perfection of Land Appropriate Large-scale Operation Policy in the New Period，Agricultural Reformation and Rural Progressing—Annual Conference Proceedings of China Agriculture System Engineering Society 2010会议论文，ISTP检索
11. 刘兆军，农村集体经济组织发展的法律困境与对策探析，《农村经营管理》，2010.02
13. Liu Zhaojun，Research on System Perfection of Land Contract Management Right Transfer：A Case Study of Heilongjiang Province，the Fourth International Institute of Statistics&Management Engineering Symposium（IISMES 2011）会议论文。
获奖概况：
2014.09 试论我国农产品流通法制建设的完善 中国法学会第九届东北法治论坛一等奖
2013.02 加强农村社会管理创新的法制保障 哈尔滨市优秀法学论文二等奖
2011.01 土地适度规模经营政策探析 哈尔滨市优秀法学论文三等奖
2010.01 农村土地使用权流转问题的研究 哈尔滨市法学研究重点课题二等奖
2011.11 农地制度变革中的农民地权问题研究 黑龙江省第二届社会科学术年会三等奖
2009.11 矿产资源开发利用的法制建设探析 全国副省级城市法学会第21次年会二等奖 | 
